Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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