Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms