Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms