Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms