Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp39Q02525 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms