Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uba1Q02053 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uba1Q02053 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uba1Q02053 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uba1Q02053 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms