Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms