Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms