Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms