Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabpaQ00422 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms