Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp9bP98195 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms