Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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