Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms