Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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