Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms