Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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