Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms