Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms