Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms