Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza3P70190 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza3P70190 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms