Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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