Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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