Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms