Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms