Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms