Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Strn4P58404 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Strn4P58404 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Strn4P58404 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms