Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms