Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms