Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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