Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms