Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcanP55066 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcanP55066 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms