Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NrlP54846 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrlP54846 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms