Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms