Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms