Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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