Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SqleP52019 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SqleP52019 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SqleP52019 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SqleP52019 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SqleP52019 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SqleP52019 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SqleP52019 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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