Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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