Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms