Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GdnfP48540 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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