Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms