Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300 ms