Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tulp2P46686 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms