Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms