Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms