Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms