Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TpoP35419 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TpoP35419 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TpoP35419 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TpoP35419 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms