Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms