Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BgnP28653 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms