Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms