Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LoxP28301 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LoxP28301 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LoxP28301 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LoxP28301 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms